iHEALTH pone a disposición de la comunidad científica una base de datos de imágenes cardíacas adquiridas en resonancia magnética de bajo campo
El dataset reúne exámenes de 110 voluntarios sanos realizados en un resonador clínico de 0,55 T, y se encuentra disponible en acceso abierto a través de la plataforma Zenodo.
El Instituto Milenio iHEALTH publicó una nueva base de datos de imágenes cardíacas en la plataforma Zenodo, un repositorio de acceso abierto desarrollado bajo el programa europeo OpenAIRE y operado por la Organización Europea para la Investigación Nuclear (CERN), que permite a investigadores de todo el mundo compartir datos para investigación. Esta iniciativa da continuidad a la publicación de la base de datos de imágenes de rodilla que el Instituto puso a disposición de la comunidad científica hace un tiempo.
El dataset contiene exámenes de 110 voluntarios sanos, adquiridos en el resonador magnético de bajo campo de 0,55 T de iHEALTH. Con ello se transforma en un recurso de mayor escala, orientado a contribuir a la disponibilidad de datos en el área de la imagenología médica cardiovascular.
Para Claudia Prieto, directora e investigadora principal de iHEALTH, este nuevo conjunto de datos es una muestra concreta del avance del Instituto en esta línea de trabajo: “cuando publicamos la base de datos de rodilla dijimos que era un punto de partida, y hoy damos un paso importante. Contar con imágenes cardíacas de 110 voluntarios adquiridas en un equipo de bajo campo, más accesible que los convencionales, abre nuevas oportunidades para desarrollar y validar métodos de reconstrucción, análisis e inteligencia artificial aplicados a la salud cardiovascular”.
Además, agregó: “a diferencia de la mayoría de las bases de datos disponibles, que sólo entregan las imágenes ya reconstruidas, este dataset incluye también los datos crudos de la adquisición, lo que permite a otros grupos trabajar desde el origen de la señal y comparar sus propios métodos de reconstrucción”.
Las enfermedades cardiovasculares siguen siendo una de las principales causas de muerte en Chile y en el mundo. “Por eso creemos que es fundamental que existan datos abiertos y de calidad que permitan a investigadores de distintos países avanzar en herramientas diagnósticas que en el futuro puedan llegar a más personas, especialmente en lugares donde hoy el acceso a la resonancia magnética es limitado” complementó la directora.
El proyecto fue liderado por Claudia Prieto y René Botnar, investigador de iHEALTH, como Project Leaders, mientras que Ignacio Celis, tecnólogo médico del equipo, estuvo a cargo de la creación de la base de datos y de la realización de los exámenes como Data Collector.
Características de los datos
A cada uno de los 110 voluntarios se le aplicó un mismo protocolo de examen en el resonador de bajo campo, compuesto por dos tipos de adquisiciones.
En primer lugar, se obtuvieron imágenes de cine 2D, que permiten observar el movimiento del corazón a lo largo del ciclo cardíaco, en tres vistas: 4 cámaras, 2 cámaras y eje corto. Estas vistas son las utilizadas habitualmente en la práctica clínica para evaluar la anatomía y la función cardíaca.
Por su parte, se adquirieron mapas T1 y T2 2D en eje corto, técnicas cuantitativas que entregan información sobre las propiedades del tejido del músculo cardíaco y que son de utilidad para la caracterización de distintas patologías.
Cabe destacar que se cuenta con el consentimiento informado de todos los voluntarios, obtenido previo a la realización de los exámenes, y con la aprobación ética para compartir las imágenes de manera anonimizada con la comunidad científica.
Link a la base: https://zenodo.org/records/23089164
